《中國佛教醫藥全書》是我國佛教界對醫學界所做貢獻的重要文化體現。佛教博大的智慧已經被越來越多的人所接受，佛教醫學在我國歷史長河中，對救死扶傷起到了非常關鍵的作用，卻沒有引起足夠的重視。因此，此書的出版，必將引起“發掘佛教醫藥寶藏，弘揚佛教醫藥文化”的風潮，為我國醫學的發展提供一種新的思維方式和重要參考。
本書所收文獻涉及佛教大藏經內外，主要有以下幾部分組成。
第一部分為大藏經內文獻。我們以歷史上出版的數種漢文大藏經（主要包括磧砂藏、趙城藏、永樂北藏、嘉興藏、龍藏、大正藏、卍續藏）為基礎，將其中涉及醫學的部分挑選出來，並比對各種版本，選擇最優良的本子作為影印依據。同時，提供給讀者現代標點本。此部分文獻主體分為兩部分，一為佛經醫論，一為涉醫佛經。
第二部分為我國歷代醫僧作品。代表作品有《竹林女科》《天竺膏藥方》《岳少保易筋經》《少林寺秘方選集》《慎柔五書》《龍樹菩薩眼論》
第三部分為我國歷代居士醫著。代表作品有《醫門法律》《醫門棒喝》《濟世全書》《本草經集注》《林文忠公戒煙方》《靜坐法精義》等。
上述兩部分的著作主體為佛教信徒，他們把佛教慈悲濟世的精神融入書中，為後人留下了豐富的醫療經驗和獨特的醫藥秘笈。我們從全國各大圖書館調取了相當多的第一手資料，並將少林藥局珍藏多年的傷科古籍拿出來。這些文獻中相當大的一部分屬於首次公開出版。